纳粹德国与苏联就具体瓜分波兰问题达成协议
波兰国徽
从1938年10月起，希特勒向波兰提出波兰走廊的问题，并向波兰发出战争威胁。1939年8月23日，苏德签订了互不侵犯条约和划分势力范围的秘密议定书（苏联一直否认该秘密议定书的存在）。1939年9月1日，德国以闪电战突袭波兰，迅速侵占波兰大部分领土，波兰军民英勇抗战。9月17日，波兰政府逃亡国外，先在巴黎组成了以西科尔斯基（Władysław Eugeniusz Sikorski）将军为首的流亡政府。法国战败后，1940年，流亡政府迁往英国。与此同时，9月17日，苏联领导人斯大林（Иосиф Виссарионович Сталин）为了建立东方防线，命令60万苏联红军越过苏波边界，进入波兰东部，占领了西乌克兰和西白俄罗斯。9月18日，苏军与德军在布列斯特—立托夫斯克会师，德、苏两军以皮萨河—那累夫河—维斯瓦河—桑河一线为界分割了波兰。9月28日，德军攻陷华沙，波兰再次沦亡。波兰人民开始了反法西斯民族解放战争。
1941年德国进攻苏联，并全部占领了波兰领土，而后苏联与波兰流亡政府建立外交关系。 1942年，流亡政府在国内建立了国民军，同年，苏联支持的波兰共产党人建立了波兰工人党和人民军，在地下同纳粹占领军展开了艰苦卓绝的斗争。为此，许多人付出了珍贵的生命。1943年，由于发生了卡廷森林事件，流亡政府和再次和苏联断交。
随着战争形势的发展，苏军的反攻将战线逐渐推进到波兰境内。1944年元旦，在工人党的倡议下，成立了全国人民代表会议，由贝鲁特（Bolesław Bierut）任主席。1944年7月22日，全国人民代表会议在海乌姆组成了波兰民族解放委员会，颁布了具有历史意义的《七月宣言》，宣告波兰新国家诞生。
1944年8月，苏联红军推进到了华沙的近郊，在英国的流亡政府为了在新生的波兰国家权利机构中获得更大的利益，华沙犹太人英雄纪念碑就命令在华沙的地下国民军发起起义，这就是著名的华沙起义。由于斯大林认为，这种不负责任的做法不应得到同情，从而苏军并没有给予华沙城内起义军太多的支持，在纳粹德军的血腥镇压下，起义失败，疯狂的希特勒下令将华沙夷为平地，许多珍贵的文物古迹遭到毁坏，大部分华沙人也被送入死亡集中营。事后证明，苏联应为华沙起义的失败负有一定道义上的责任。1945年1月17日，苏波军队解放了已成为废墟的华沙。4月，波苏两国签订了友好互助与经济合作条约。6月，波兰民族解放委员会改组为临时民族统一政府。
根据雅尔塔和波茨坦会议的决定，确定了波兰东、西部边界，东部以寇松线为波苏边界，西部波德边界则向西推移至奥德－尼斯河，并把什切青和施维诺威斯划入边界的波兰一侧。这样，波兰的版图整体西移了200多公里，面积也比战前缩小了约7.6万平方公里，大约是损失了20% 的领土。
在二战中，波兰人民为反法西斯战争作出了巨大的牺牲，大约有600万波兰军人和平民在这场战争中丧生。在波兰境内发现了许多纳粹屠杀犹太人和其他平民的集中营，其中最著名的是奥斯维辛（Auschwitz）集中营。在所有参战国中，若按人口比例来计算的话，波兰是死伤最惨重的国家。
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