1、性质不同。不动产证，是房产证和土地使用权证书的合二为一的证书。
2、防辐射标签不同。房产证没有防辐射标签，不动产证有防辐射标签。
3、内容不同。房产证内页内容包括房屋产权人、共有情况、房屋坐落、登记时间、房屋性质、规划用途、房屋状况和土地状况。
而不动产证内页规定了权利人、证件种类、证件号、共有情况、权利人类型、登记原因、使用期限、取得价格。
4、发证机关不同。房产证的发证机关是市(县)房地产管理局(房产管理局)或市(县)人民政府，不动产权证的动产登记机构由县级以上人民政府依法确定的、统一负责不动产登记工作的部门。
5、版本不同。房产证书只有一个版本，而不动产证书有两个版本、单一版和集成版两个版本。
6、费用不同。房产证需要当时办理这些证书时，要按照土地面积、房产面积分别进行两次测绘、缴纳两次测绘费用，缴纳两份制证成本费；不动产证测绘只要一次就行，制证的成本费也仅收一次。
