首先，微波炉和烤箱的工作原理就千差万别。微波炉的加热原理是通过一种高频电磁波瞬间穿透食物，使食物内的极性分子振荡，在相互碰撞时摩擦生热，短时间内起到加热食物的作用;而烤箱则是利用电热原理，通过机内的电热管发热给食物传递热能，让食物由外到里加热。这就不难辨别，为什么微波炉热的馒头从里到外硬邦邦，而烤箱烤出来的则是外焦里软。
其次，由于微波炉和烤箱的工作原理不同，所以同样加热一种食物，两者的加热时间也不同。如果想要快速加热请选微波炉，但追求食物的色形味那么还是烤箱比较一流。
此外，两者的适用场景也不尽相同。通常情况下，人们热饭、解冻都会使用微波炉，而烧烤、烘焙就会用到烤箱了。虽然现在有些微波炉也具备烧烤功能，但是烤一些鸡块、鸡翅等小体积的食物还可以接受，如果要烤整鸡、烤鸭等体积较大的食物，还是烤箱用起来更实用。
